Sekundárny metabolizmus (Úvod do štúdia prírodných látok)

E-book

Dušan Barabas a kol.

Predkladaný text je výsledným produktom práce v rámci projektu „Tanuljunk egymástól!/Učme sa jeden od druhého!“ Projekt vznikol na základe dlhoročných kontaktov pracovníkov Centra regionálnych výskumov Maďarskej akadémie vied a Ústavu geografie Prírodovedeckej fakulty UPJŠ v Košiciach ako prirodzená snaha o rozširovanie vzájomnej spolupráce. Prvým krokom bola spolupráca v rámci projektov Intereg II, do ktorej sa zapojil široký okruh pracovísk tak akademického, ako aj mimo akademického prostredia. Tento prvý pokus nebol úspešný z dôvodu administratívnych chýb. Z toho dôvodu bol po vzájomnej dohode s Maďarskou stranou pripravený a vypracovaný projekt HUSK/0801/1.6.1/0003 „Tanuljunk egymástól!/Učme sa jeden od druhého!“, ktorý bol schválený a spolufinancovaný Európskym fondom regionálneho rozvoja v rámci Programu cezhraničnej spolupráce Maďarská republika - Slovenský republika 2007 - 2013.

Konkrétny cieľ projektu zahŕňal usporiadanie niekoľkých stretnutí, kde slovenskí a maďarskí odborníci v oblasti geografie prezentovali svoj výskum a myšlienky. Zároveň sa podujali dodať materiál reprezentujúci ich prácu. V rámci šiestich stretnutí sa počas prvej etapy projektu stretlo 30 výskumníkov zo Slovenska a 30 výskumníkov z Maďarska, ktorí predstavili výsledky svojej práce a dodali záverečné výstupy v rozsahu 1 autorského hárku.

Stretnutia neboli samoúčelné. Vznikol rámec pre kooptovanie vedeckých tímov, ktoré by mohli aj v budúcnosti naďalej spolupracovať. Táto kooperácia určite prispeje nielen ku konkrétnym osobným kontaktom, ale bude aj základom pre tvorivú vedu na oboch stranách hranice. Projekt trvajúci jeden rok priniesol vedecký zborník, v ktorom sú predstavené niektoré špecifické problémy z geografie Maďarska a Slovenska. Ich predstavenie poslúži k porovnaniu teoreticko-metodologických východísk použitých pri riešení podobných problematík, prípadne umožní porovnať efektívnosť a výpovednú hodnotu dosiahnutých výsledkov. V zborníku sú publikované aj texty, ktoré nemajú tematicky zodpovedajúci náprotivok. Sú však inšpiráciou pre výskumníkov z opačnej strany. Predložený materiál si taktiež kladie ambíciu slúžiť ako doplnkový študijný text pre slovenských a maďarských vysokoškolákov, ako aj odbornú a laickú verejnosť.

Veríme, že vďaka realizovanému projektu a jeho výstupu vo forme vedeckého zborníka sa nám podarí stierať existujúce hranice a byť bližšie jeden k druhému.

Download the e-book for free (pdf)

E-book

Adriana Zeleňáková - Jozef Bednarčík

Recenzovaný zborník príspevkov z vedeckej konferencie NANOVIR

Hlavným cieľom vedeckej konferencie NANOVIR bola prezentácia vedeckých výsledkov, získaných počas riešenia projektu NANOVIR – Nanočastice pre riešenie diagnosticko- terapeutických problémov s COVID-19, spolufinancovaného z Európskeho Fondu Regionálneho Rozvoja v Operačnom Programe Integrovaná Infraštruktúra 2014 – 2020, ITMS: 313011AUW7. Projekt bol riešený v období 1.1.2021 – 30.6.2023 a bol podporený sumou 1 916 004,79 EUR. Spolupodieľali sa na ňom tri spoluriešiteľské organizácie: Univerzita Pavla Jozefa Šafárika v Košiciach ako hlavný riešiteľ, Univerzita veterinárskeho lekárstva a farmácie v Košiciach ako partner č. 1 a Ústav experimentálnej fyziky Slovenskej akadémie vied ako partner č. 2.

Download the e-book for free (pdf)

E-book

Gabriela Andrejková - Ľubomír Antoni

Machine learning addresses the issues of how computer programs recognize complex patterns and make decisions based on data. In these university textbooks, we focus on theoretical knowledge in the field of machine learning in which we present the creation of concepts for objects, the preparation of concepts, hypotheses and the process of learning from examples. We describe Boolean formulas and their representations, probabilistic learning, linear and logistic regression, linear modeling and classification. Clustering and the Bayesian approach to machine learning conclude this publication.

University textbooks are intended for students of master's degree programs in computer science.

Download e-book for free (pdf)

E-book

Nataša Tomášková

Selected tasks and problems from biochemistry – metabolism follow biochemistry lectures on metabolism and individual metabolic pathways for students of the second and third year of the bachelor’s degree in the fields of chemistry, biology and their combinations with other fields. Scripts provide an opportunity to better understand the lectured subject matter of metabolism through the solution of tasks and problems as serve as a basis for one-hour exercises. The scripts are divided thematically into eleven chapters, and each chapter contains 10 tasks and 7 problems. At the beginning of the chapters there is a short description and explanation of the given metabolic pathway. However, when solving the tasks, the student must focus mainly on the curriculum that was presented on the given topic in the lecture. Subsequently, at the end of chapter, answers to problems are also presented. These scripts are intentionally accessible only in electronic form. The reason is the effort to continuously update and modernize individual tasks.

Download e-book for free (pdf)

E-book

Andrej Mock

The structure of the animal body is extremely varied. Each species has its distinctive morphological features, which bears as a testimony to long-term development and belonging to the developmental lineage. At the same time, the body has been tested for a long time by natural conditions, resulting in unique adaptations to the environment and life strategy. Despite this admirable variety - which includes both recent and fossil animals and which we have far from mapped – a comparison of body parts brings knowledge we can generalize: the main building principles, and boundaries within which phenotypic diversity is realized.

Comparative animal morphology today uses the latest methodological material and knowledge from other disciplines, from genetics, molecular biology and experimental embryology, through progressive imaging methods (e.g. electron microscopy, computer micro-tomography) and the possibilities of subsequent software processing of image material (measurement, staining, etc.) to the view of physics, chemistry, statics and geometry on the structures (to nanostructures) of the living body. Detailed knowledge of historical and contemporary conditions on Earth is an important interpretative context in the study of animal morphology. Surprisingly, the knowledge accumulated after centuries of research is now rapidly supplemented by new knowledge, and often the traditional knowledge is subsequently reinterpreted. Finally, and no less important, in studying animal (and human) morphology, we learn surprising knowledge about ourselves.

The author of the presented textbook had the ambition in a simplified form to introduce the reader, especially the student of biological studies, into a dynamic and fascinating scientific discipline, as the current comparative animal morphology is.

Stiahnite si e-knihu zadarmo (pdf)

E-book

Jozef Kováčik

Tieto „Návody na cvičenia“ prezentujú stručný prehľad bežne používaných metodík i progresívne metodiky napr. s použitím kvapalinovej chromatografie a fluorescenčného mikroskopu. Jednotlivé úlohy sa selektovali na základe výskumného zamerania Katedry botaniky PF UPJŠ v Košiciach z hľadiska „stresovej fyziológie“. Niektoré úlohy je tiež možné využiť v rámci predmetu „Ekológia rastlín“. Ako modelová rastlina pre jednotlivé úlohy sa typicky používa rumanček kamilkový z dôvodu dlhoročnej histórie jeho výskumu na Katedre botaniky PF UPJŠ a jeho nenáročnosti na kultiváciu v laboratórnych podmienkach. Jednotlivé kapitoly prezentujú aj stručný význam sledovaných parametrov, princíp stanovenia a metabolizmus (vznik alebo odbúravanie) s cieľom naznačiť ich vzájomný kontext, keďže stanovenie individuálneho parametra nemôže poskytnúť všeobecnejšiu výpoveď o celkových príčinách a dopadoch pozorovanej zmeny (ale naopak, môže poskytnúť predpoklad pre preverenie hypotézy na úrovni iných parametrov...). Pre hlbšie štúdium jednotlivých problematík existuje dostatok kvalitných zahraničných monografií a prehľadových (tzv. „review“) článkov. 

Download the e-book for free (pdf)

E-book

Natália Raschmanová - Ľubomír Kováč

The text summarizes the basic knowledge about the functioning of the soil ecosystem with a focus on soil protists and dominant groups of soil animals. Characteristics of each soil animal group include basic morphology, ecology, distribution, population dynamics and their importance in the soil ecosystem. The aim of the text is to gain a basic understanding of the diversity and interactions of soil fauna with the soil environment. It deals with the ecological classification of soil fauna on the basis of body size, presence in the soil during the life cycle, food preference and by locomotion. It highlights important morphological and ecophysiological adaptations of soil fauna to physical and chemical environmental factors. The text also gives an overview of the basic methods in the field collection of soil fauna and their extraction from soil samples under laboratory conditions. It further informs on the method of taxonomic identification and ecological evaluation of soil fauna communities. Discusses the soil fauna of different types of ecosystems. It highlights the differences in soil fauna communities that inhabit grassland and forest habitats, and agricultural soils. This teaching material is intended for students in biology degree programmes.

Download the e-book for free (pdf)

E-book

Peter Paľove-Balang

Predložený učebný text „Príjem a transport minerálnych látok v rastlinách“ v slovenskom jazyku poskytuje v zrozumiteľnej podobe všeobecný prehľad v problematike príjmu a distribúcie látok. Jednotlivé kapitoly zoznámia študentov z vlastnosťami pôdneho prostredia, ktoré majú výrazný vplyv na dostupnosť látok, ďalej s transportom látok cez membrány ako aj na stredné a dlhé vzdialenosti. Text obsahuje najnovšie poznatky z anglickej literatúry, doplnené schémami a grafmi, ktoré vytvoril autor na základe vlastného výskumu, alebo spracovaním viacerých zdrojov.

Učebné texty sú určené predovšetkým pre študentov magisterského štúdia v odbore biológia, alebo ekológia a predpokladajú aspoň základné poznatky z fyziológie rastlín.

Download the e-book for free (pdf)

E-book

Zuzana Jurašeková

Úvod k praktikám k experimentálnym metódam biofyziky

The university textbook titled Laboratory Techniques and Calculations is designed for the first-year students of the bachelor's degree in Biophysics at the Institute of Physics, Faculty of Sciences, P. J. Šafárik University in Košice. The objective is to equip students with fundamental knowledge and practical skills for the work in a chemical laboratory. It is essential for addressing different biophysical issues and experiments that students will have to solve later. The textbook comprises three principal sections: a theoretical part focused on the calculations, a section dedicated to laboratory work, and the last part offers a brief introduction to spectroscopy. The theoretical part summarizes the basic definitions and equations related to the characterization and preparation of solutions and mixtures. The second, most comprehensive part provides guidance and suggestions for safe and efficient practices in a chemical laboratory. The primary focus is on the manipulation of chemical substances and the use of specific small laboratory instruments and equipment. The fundamental laboratory procedure guides for the selected laboratory works are also provided. As part of a short introduction to spectroscopy, students can become familiar with fundamental spectroscopic concepts and principles. UV-VIS absorption spectrophotometry receives special attention, along with a brief introduction to fluorescence. The textbook is supplemented by various practical and theoretical tasks, as well as numerous web links to further explanatory texts and videos.

Download the e-book for free (pdf)

E-book

Adriana Zeleňáková

One of the fundamental characteristics of the magnetic state of ferromagnetic materials is the existence of a domain structure. The university textbook "MAGNETIC DOMAINS: SPECIAL PHYSICAL PRACTICE 1" is intended primarily for students of the Master's programme in Physics of Condensed Matter FKLm and for the PhD programme in Progressive Materials PMd within the profile subject Special Practice 1 at the Institute of Physical Sciences of the Faculty of Sciences of the Pavol Jozef Šafárik University in Košice.  The textbook is divided into seven chapters. The first chapter is devoted to the basics of domain theory, including the history of domain observation and the specification of different types of energies in ferromagnetic body. The second chapter presents the relationship between domain structure and magnetisation processes in ferromagnetic materials The third chapter describes the different types of domain-wall interactions with the defect. The fourth chapter illustrates examples of domain structure in selected ferromagnetic body such as grain oriented and non-grain oriented electrical steels, amorphous and nanocrystalline ribbons. The fifth chapter summarises an overview of the different experimental methods used to visualise the domain structure and their advantages or disadvantages with respect to the structure of ferromagnetic materials. The last two chapters, the sixth and the seventh, are devoted to specific experimental tasks for observing the domain structure of a selected polycrystalline sample using the optical microscope Bitter powder method and the MFM (magnetic force microscopy) method. During the preparation of this undergraduate text, its individual parts were developed using the foreign language literature listed in the recommended references.

Download the e-book for free (pdf)

E-book

Jana Shepa (ed.)

The book of abstracts from the second year of the international conference Spring electrochemical meeting is composed of contributions from the participants of this student conference.

The conference consisted of one invited lecture and ten competing student lectures. The message of this meeting is to create a dialogue between students of electrochemistry and the mutual exchange of knowledge. All contributions are professionally processed and inspiring.

Download the e-book for free (pdf)

E-book

Daniela Kladeková

Tento vysokoškolský učebný text je určený študentom chemických a ekologických odborov na Prírodovedeckej fakulte Univerzity P. J. Šafárika v Košiciach a má poslúžiť ako pomôcka pre experimentálne cvičenie z koloidnej chémie. Koloidná chémia je významnou súčasťou teoretického základu chemických vied, patrí medzi novšie interdisciplinárne odbory prírodných vied. Spája poznatky z oblasti fyzikálnej chémie, fyziky a biológie, pričom využíva aj solídne znalosti z matematiky a ďalších vedných odborov. Pri pochopení problémov koloidnej chémie sú často nevyhnutné aj experimenty, ktoré modelujú predstavy o priebehu javov a zákonitostí, ktorými sa tento vedný odbor zaoberá. Preto je pre zvládnutie učebnej látky z koloidnej chémie také dôležité a podstatné aktívne absolvovanie experimentálneho cvičenia. Pri výbere úloh pre tieto skriptá bolo treba rešpektovať aj značné obmedzenia dané možnosťami laboratórne prístrojového a materiálového vybavenia nášho pracoviska. Napriek tomuto obmedzeniu však môžu študentom ilustrovať základné teoretické fyzikálno-chemické princípy koloidne disperzných sústav, a čo je dôležité – ich pochopenie môže prispieť k porozumeniu niektorých dôležitejších zvláštností koloidných javov.

Download the e-book for free (pdf)

Andrej Mock

Burda - Kováčov, Slovensko, 4.-7.10.2017

Abstrakty prednášok českých a slovenských zoológov, ekológov a fyziológov, ktorí ako modelové skupiny študujú pôdne článkonožce v taxónoch Myriapoda a Oniscidea, prezentovaných na 10. seminári v Kováčove pri Chľabe na Slovensku.

Download the e-book for free (pdf)

E-book

Milan Žukovič

This textbook is intended for master's degree students and is a follow-up to the Computational Physics I course studied at the bachelor's level. The content of the textbook Computational Physics II focuses on stochastic methods of solving physical problems, mainly on Monte Carlo (MC) simulation of many-particle systems. The focus on this computationally intensive approach is motivated by the gradual increase in the computing capacities of ordinary computers as well as the introduction of high-performance computing clusters. This has led to significant progress in the development of new simulation techniques, thanks to which MC simulations have found application in various areas of research and application practice. Considering the main research focus of the department, this text is particularly devoted to the presentation of basic and more advanced MC simulation techniques applied to a simple Ising spin model in order to investigate its magnetic, thermodynamic and critical properties. The next part is devoted to MC simulations of random processes. It focuses on the simplest but also the most basic random walk process and demonstrates its applications in financial analysis and the solution of a quantum system described by the time-dependent Schrödinger equation. The last part is dedicated to the basics of molecular dynamics, applied to simulating the classical movement of atoms in a given force field. By mastering the problems addressed in this course, students will obtain a potential tool for working out of their diploma theses, or a methodology useful for their further scientific and research practice in the field of investigating of complex systems. The lectured topic is subsequently exercised in the form of preparing projects implemented in the freely distributable software Octave, which is easy on the user's programming skills and which students have the opportunity to familiarize themselves with in the previous study.

Download e-book for free (pdf)

E-book

Renáta Oriňaková

Download e-book for free (pdf)

E-book

Adela Kravčáková - Stanislav Vokál - Janka Vrláková 

The presented “General Physics IV, Part 1: Atomic Physics” is intended as a basic study material for lectures from General Physics IV in the second year of bachelor-level study of physics and interdisciplinary study in combination with physics at the Faculty of Science, P. J. Šafárik University in Košice. The content covers the first part of the given course of physics, devoted to atomic physics.

The aim of the course is to obtain basic information about the structure of the atom and the electron shell of the atom.

Download the e-book for free  (pdf)